由于蓮子開花的時(shí)刻有早、有晚，為此有必要進(jìn)行分批采收。蓮子采收要當(dāng)令，不宜過早，也不宜過晚。過早采收，蓮子尚嫩，含水量大，晾干后易干癟，且質(zhì)量差，產(chǎn)值低；過晚采收，一方面蓮子易被風(fēng)吹而搖落到水中，然后造成損失；另一方面，蓮子果皮變得堅(jiān)硬，不易進(jìn)行剝殼加工。蓮子當(dāng)令采收的觀感是：蓮蓬出現(xiàn)青褐色，蓮孔張開，邊緣帶黑色，蓮子果皮出現(xiàn)灰黃或灰褐色，子粒飽滿等。

蓮子分批成熟，在長江流域一般在7月份采收首批蓮子，由于此時(shí)采收的果實(shí)是在黃梅天氣發(fā)育成熟的，所以稱為“梅子”，亦稱“梅蓮”，又由于此為首批蓮子，所以又稱“早子”、“報(bào)訊子”梅子一般在開花后30~40天到達(dá)采收成熟，由于這時(shí)溫度較高，所以蓮子成熟較快，一般每隔2~3天即要采收1次8~9月份采收的蓮子，果實(shí)是在伏天發(fā)育成熟的，所以稱為伏子”，也稱“伏蓮”。

伏子一般在開花后30~35天到達(dá)采收成熟，因受到暴曬，蓮蓬色澤偏黑。伏子在高溫、干旱的伏天成熟很快，所以也應(yīng)每隔2~3天采收1次。伏子粒大飽滿，質(zhì)量好，產(chǎn)值高，其產(chǎn)值約占蓮子總產(chǎn)值的65%~70%。9月下旬至10月份采收的蓮子，果實(shí)是在秋天里發(fā)育成熟的，所以稱為“秋子”，亦稱“秋蓮”。秋子發(fā)育成熟過程中氣溫較低，陽光也不是那么強(qiáng)烈，蓮蓬不易發(fā)黑，只需變成青褐色，蓮孔張開，邊緣稍帶黑色，即可采收。秋子成熟慢，可每隔5~7天采收1次。秋子顆粒較小，質(zhì)量稍差，產(chǎn)值一般占總產(chǎn)值為20%~30%。

采收蓮子時(shí)，可每2~3米開一條路，每次采收沿同一道路進(jìn)行，用手摘下蓮蓬，或用帶柄的小鉤鉤下蓮蓬，帶至田外，剝出蓮子。采收深水蓮，當(dāng)水位達(dá)70~80厘米時(shí)，須撐小船采收。采收時(shí)，1人在船尾撐船緩行，1人站立船前部用帶柄小鉤將蓮蓬鉤下。深水蓮子的栽培條件不及淺水蓮，所以產(chǎn)值也一般沒有淺水子蓮高，并且質(zhì)量也一般不及淺水子蓮。

蓮蓬采收后，要盡快地脫出蓮子，并薄薄地?cái)偟綀龅厣媳瘢刻焐舷路瓌?dòng)2~3次，約經(jīng)5~7天，當(dāng)蓮子能脫離殼皮時(shí)，即為干燥。晾干的帶殼蓮子叫干殼蓮，可將干殼蓮裝人麻袋中儲(chǔ)藏，具體方法是：取麻袋數(shù)條，并將其晾干，然后將干殼蓮裝人麻袋中，置于陰涼干燥處，下墊一層20厘米厚的干谷殼，再鋪上油氈和蘆席防潮，并且在儲(chǔ)藏過程中要避免雨雪等侵襲，如此可進(jìn)行長時(shí)間儲(chǔ)藏。

蓮子去殼、去嫩皮和除去蓮心后，剩下的蓮肉，稱為通心蓮子通心蓮子儲(chǔ)藏期間簡單吸濕發(fā)霉和生蟲，因此應(yīng)注意儲(chǔ)藏在低溫通風(fēng)和干燥的環(huán)境中。少量儲(chǔ)藏時(shí)，可每50千克干通心蓮子用干辣蓼草2千克，墊到容器內(nèi)下部，然后裝入蓮子并加蓋封口，這樣可保存到第二年新蓮子上市，一般不生蟲、不發(fā)腐大量儲(chǔ)藏可用麻袋等盛裝放入低溫冷庫中儲(chǔ)藏。